Usluge zdravstvene zaštite stanovništva na području opštine Zaječar obavljaju zdravstvene ustanove:
- Zdravstveni centar "Zaječar"
- Zavod za zaštitu zdravlja "Timok" - Zaječar
- Apotekarska ustanova "Lek" - Zaječar
- više privatnih ordinacija i apoteka
U zdravstvu Zaječara radi oko 1.500 medicinskih radnika, od čega je oko 14 doktora nauka - od njih jedan je akademik.
ZDRAVSTVENI CENTAR raspolaže većim brojem najsavremenijim aparata, među kojima:
skenerom, gama-kamerom, ultra-zvučnim aparatima itd. Veći deo ovih sredstava je nabavljen sredstvima samodoprinosa građana. Svoju delatnost Zdravstveni centar obavlja preko: Doma zdravlja i Bolnice.
Delatnosti službe opšte medicine na teritoriji opštine Zaječar obavljaju se u dispanzeru opšte medicine Doma zdravlja, sedam zdravstvenih stanica (četiri u gradu i tri u selima) i 37 zdravstvenih ambulanti u selima. Svi oni organizacijski se nalaze u sastavu Doma zdravlja.
U okviru Doma zdravlja određene službe obezbeđuju usluge zdravstvene zaštite stanovnika Zaječarskog i Borskog okruga, i to: nuklearna medicina, maksilofacijalna hirurgija, infektivno, neonatologija, dečja hirurgija, dermatovenerologija, patologija i dr.
Bolnica, u okviru svog delokruga rada, pruža specijalističko-konsultativne usluge kroz rad sledećih službi: internističke, hirurške, urološke, oftalmološke, neuropsihijatrije, ortopedske, neonatološke, nefrološke, nuklearne, ginekološko-akušerske, transfuzije, anestezije, patologije, pedijatrije, dečje hirurgije i dermatovenerologije.
Opšta bolnica raspolaže kapacitetom od 535 postelja za potrebe stacionarnog lečenja pacijenata.
ZAVOD ZA JAVNO ZDRAVLJE "TIMOK" obavlja socijalno-medicinsku i higijensko-epidemiološku zdravstvenu delatnost na području opštine Zaječar. U okviru svoje delatnosti Zavod pruža preventivne i dijagnostičko-zdravstvene usluge iz oblasti zdravstvene zaštite i odgovarajućih užih specijalnosti:
- socijalne medicine
- epidemiologije, mikrobiologije, parazitologije i virusologije
- higijene sa zaštitom životne sredine
- medicinske biohemije
- toksikološke hemije
- sanitarne hemije
- komunalne higijene
- školske higijene
- higijene ishrane
- ekotoksikologije
PRIVATNI SEKTOR: Na teritoriji naše opštine trenutno radi više apotekarskih ustanova (Menta, Nana, Droga, Uni-promet, Miogen, Ana i dr.), veći broj stomatoloških ordinacija (Art-dent, Ivodent, dr Đorđević, dr Živković, dr Predić, Bobi i dr.), privatne lekarske ordinacije "Anima" (neuropsihijatrijska ordinacija dr Mihajla Jagodića) i Poliklinika dr Borinke Đoković, oftalmološka ordinacija "Vid-optik" i dr.
APOTEKARSKA USTANOVA "LEK" bavi se prometom leko-va i lekovitih pripravaka na veliko i malo. U sastavu ove ustanove nalazi se šest apotekarskih jedinica (tri u gradu, jedna u Domu zdravlja, jedna u Gamzigrad-skoj Banji i jedna u Salašu).
